电动自行车充电器的常见故障可分为三类：1. 高压故障；2. 低压故障；3. 高压、低压均有故障。

高压故障的主要现象是指示灯不亮，其特征有保险丝熔断、整流二极管 D1 击穿、电容 C11 鼓包或炸裂、Q1 击穿、R25 开路、U1 的 7 脚对地短路、R5 开路、U1 无启动电压，更换以上元件即可修复。若 U1 的 7 脚有 11 V 以上电压、8 脚有 5 V 电压，说明 U1 基本正常，应重点检测 Q1 和 T1 的引脚是否有虚焊。若连续击穿 Q1 且 Q1 不发烫，一般是 D2、C4 失效；若是 Q1 击穿且发烫，一般是低压部分有漏电或短路、电流过大，或 UC3842 的 6 脚输出脉冲波形不正常，导致 Q1 的开关损耗和发热量大增、Q1 过热烧毁。高压故障的其他现象有指示灯闪烁、输出电压偏低且不稳定，一般是 T1 的引脚有虚焊，或 D3、R12 开路，TL3842 及其外围电路无工作电源。另有一种罕见的高压故障是输出电压偏高到 120 V 以上，一般是 U2 失效、R13 开路所致，或 U3 击穿使 U1 的 2 脚电压拉低、6 脚送出超宽脉冲，此时不能长时间通电，否则将严重烧毁低压电路。

低压故障大部分是充电器与电池正负极接反，导致 R27 烧断、LM358 击穿，其现象是红灯一直亮、绿灯不亮、输出电压低或接近 0 V，更换以上元件即可修复。另外 W2 因抖动使输出电压漂移：若输出电压偏高，电池会过充、严重失水、发烫，最终导致热失控、充爆电池；若输出电压偏低，会导致电池欠充。

高低压电路均有故障时，通电前应首先全面检测所有二极管、三极管、光耦合器 4N35、场效应管、电解电容、集成电路以及 R25、R5、R12、R27，尤其是 D4（16 A／60 V 快恢复二极管）、C10（63 V、470 μF），避免盲目通电使故障范围进一步扩大。

有一部分充电器输出端具有防反接、防短路等特殊功能，其实就是输出端多加一个继电器，在反接、短路情况下继电器不工作、充电器无电压输出。还有一部分充电器也具有防反接、防短路功能，其原理与此不同，其低压电路的启动电压由被充电池提供，且接有一个二极管（防反接），待电源正常启动后由充电器提供低压工作电源。

第二种充电器的控制芯片一般以 TL494 为核心，推动两只 13007 高压三极管，配合 LM324（4 运算放大器）实现三阶段充电。

220 V 交流电经 D1～D4 整流、C5 滤波得到约 300 V 直流电。此电压给 C4 充电，经 TF1 高压绕组、TF2 主绕组、V2 等形成启动电流，TF2 反馈绕组产生感应电压使 V1、V2 轮流导通，因此在 TF1 低压供电绕组产生电压，经 D9、D10 整流、C8 滤波，为 TL494、LM324、V3、V4 等供电，此时输出电压较低。TL494 启动后其 8 脚、11 脚轮流输出脉冲，推动 V3、V4，经 TF2 反馈绕组激励 V1、V2，使 V1、V2 由自激状态转入受控状态。TF2 输出绕组电压上升，经 R29、R26、R27 分压后反馈给 TL494 的 1 脚（电压反馈），使输出电压稳定在 41.2 V。R30 是电流取样电阻，充电时 R30 产生压降，此电压经 R11、R12 反馈给 TL494 的 15 脚（电流反馈），使充电电流恒定在约 1.8 A。另外充电电流在 D20 上产生压降，经 R42 到达 LM324 的 3 脚，使 2 脚输出高电压点亮充电指示灯，同时 7 脚输出低电压、浮充灯熄灭，充电器进入恒流充电阶段；而且 7 脚低电压拉低 D19 阳极电压，使 TL494 的 1 脚电压降低，这将导致充电器最高输出电压达到 44.8 V。当电池电压上升至 44.8 V 时进入恒压阶段。当充电电流降低到 0.3～0.4 A 时 LM324 的 3 脚电压降低、1 脚输出低电压、充电灯熄灭，同时 7 脚输出高电压、浮充灯点亮，且 7 脚高电压抬高 D19 阳极电压、使 TL494 的 1 脚电压上升，这将导致充电器输出电压降低到 41.2 V，充电器进入浮充。